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矿事务部：工矿登记、批准、规划；安全监察；污染监察；质量、价格监督；促进工矿业新技术应用、科技发展等。
农业事务部：农业种子、耕作制度、农药、肥料研究；农业生产监护对旱涝、病虫害、气象灾难进行预警；对农产品种植丰欠进行预测；促进农业科技应用。
内务部：警察建设与管理；边防检查与警戒；监狱建造与管理等。
水利事务部：大江大河主干流水利工程的库、渠规划、建设、监视、管理、维护等。
人事部：行政方面干部培训、调派、委任；干部资料保管等。
科技事务部：所有科技的研究、普及、宣传及人员的培养、奖励等。
民政事务部：民政户籍统计、登记、婚嫁的管理；财产的登记、转让、遗产、赠予等管理工作。
医药卫生事务部：医院建设、登记；药品登记、生产中的质量、安全、价格等监管；医护人员资格审查、发放相关证书；医疗纠纷调解、仲裁；促进医药科学发展等。
不管部：任何找不到管辖部门的一切在新安排前都由该部处理。
除此以外还有国家银行与供销总社等及一些次一级机构。
这一来政务院有十八个部级机构，设一个政务委员会，由一个总理二个副总理负责，重大问题由政务委员会会议讨论决定，正务委员会为五天一次全体会议。
政务院外还有法务院，法务院负责起草或与各专业部门协调起草各种法律；培养及对法官进行考试、审查、监督、任命。
设全国性最高法院；省级高等法院(包括巡回法庭)；府级中级法院；县级初级法庭。
各级法院分为刑事法庭；民事法庭；经济法庭；及各种专业法庭(省级开始设立)。
除了这两院沈磊将监察系统也并列起来成立了监察院，监察院除了对各种干部进行定期考察，重点监察外，对刑事案件进行公诉乃是最普遍让外界认识、并获得好感的行为。