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紧接着复活，开启了救世主模式，史密斯三名特工射向他的子弹，被他轻易定格在了身前，紧跟着冲上来的史密斯根本不堪一击。
最终尼奥将代表史密斯的这段代码撕成了碎片，另外两名特工落荒而逃，尼奥也在千钧一发之刻，返回了现实世界。
“我知道你们在哪里，我能感受到你们，你们害怕了，你们怕我，你们怕改变……我要让所有人见证真实的世界！”
在影片的结尾，尼奥与母体进行了直接对话，然后一飞冲天！
字幕落下，掌声响起，伴随着观众们激动地叫喊，保罗和杜奇·查理曼对视一眼，两个人都知道这部影片成功了。